Tujuan dasar Program Doktor Ilmu Lingkungan Perairan (PDCMA) adalah untuk melatih para profesional berkualifikasi tinggi yang dapat memasuki karir dalam penelitian dan manajemen di lembaga atau perusahaan publik atau swasta yang terkait dengan lingkungan perairan atau mengajar di tingkat pendidikan tinggi.

Program Doktor dalam Biologi memiliki durasi 4 tahun, sesuai dengan total 240 ECTS. Tahun pertama mencakup komponen kurikuler (60 ECTS) yang disusun dalam Kursus Lanjutan, berfokus pada berbagai bidang tematik bidang ilmiah Biologi (total 24 ECTS), kelas tutorial (20 ECTS), dan persiapan komponen tesis (16 ECTS). Pada akhir tahun pertama, mahasiswa harus menyerahkan dan secara terbuka mempertahankan rencana kerja doktoralnya. Evaluasi positif diperlukan untuk keabadian mereka dalam program doktor.

BiotechHealth (ICBAS dan FFUP) menawarkan pelatihan doktoral yang sangat baik dalam Bioteknologi Molekuler dan Seluler yang diterapkan pada Ilmu Kesehatan, dalam lingkungan interdisipliner dan internasional, yang mendorong kolaborasi dengan kelompok penelitian, rumah sakit dan perusahaan. Program ini menawarkan pelatihan dalam teknologi diagnostik dan terapeutik, regenerasi jaringan,

Program Doktor dalam Patologi dan Genetika Molekuler (PDPGM) menawarkan pelatihan tingkat lanjut dalam bidang patologi dan genetika molekuler. Ditargetkan untuk lulusan muda atau mereka yang memiliki gelar master dalam ilmu kehidupan dan kesehatan, program ini berfokus pada penelitian dasar dan translasi, serta diagnostik molekuler dalam biopatologi. Lulusan akan diperlengkapi untuk memimpin penelitian ilmiah